W Laboratorium Mikrobiologii Środowiskowej realizowane są prace badawcze obejmujące ocenę mikrobiologiczną różnorodnych środowisk a także izolację i identyfikację drobnoustrojów w oparciu o klasyczne testy morfologiczno-fizjologiczne oraz profile biochemiczne. W laboratorium prowadzone są także hodowle drobnoustrojów w warunkach kontrolowanych in vitro. Analiza mikrobiologiczna środowisk wykorzystuje nowoczesne metody badawcze, począwszy od klasycznych metod posiewu w komorze laminarnej aż po Technologie Zdefiniowanych Substratów (DST).
Laboratorium wyposażone jest w:
• komorę laminarną do wysiewów mikrobiologicznych;
• mikroskop świetlny Olympus;
• inkubatory do hodowli mikroorganizmów;
• czytnik mikropłytek;
• zestaw aparaturowy do oznaczeń ilościowych wykorzystujących DST (zgrzewarka, inkubator oraz analizator płytek w świetle UV).