Pracownicy Katedry prowadzą prace związanie przede wszystkim z zagadnieniami biogospodarki, godpodarki cyrkularnej, zrównoważonego gospodarowania odpadami oraz z otrzymywaniem bio-produktów i bio-preparatów
Tematyka badawcza związana jest przede wszystkim z:
- utylizacją odpadów na drodze biologicznej, gospodarką odpadami i ich recyklingiem
 - procesami prowadzonymi przez mikroorganizmy w środowisku i żywności
 - otrzymywaniem biokomponentów paszowych
 - wykorzystaniem skojarzonych procesów biologiczno-chemicznych do uzyskiwania energii i cennych produktów z odpadów przemysłowych
 - wykorzystaniem szczepów drożdży niekonwencjonalnych w procesach biotechnologicznych,
 - aktywnością biologiczną związków pochodzenia roślinnego,
 - otrzymywaniem biopreparatów (na bazie mikroorganizmów i ich metabolitów oraz ekstraktów roślinnych) o zastosowaniu przemysłowym, rolniczym i środowiskowym, o aktywności proekologicznej i/lub prozdrowotnej np. ekologicznych preparatów dla zwierząt, preparatów do usuwania odorów, biostymulatorów, biopestycydów
 - biodeterioracją materiałów technicznych, w tym obiektów dziedzictwa kulturowego, oraz metodami ich ochrony,
 - aktywnością przeciwdrobnoustrojową modyfikowanych materiałów funkcyjnych budowlanych i tekstylnych
 - bioaerozolami w środowisku, przemyśle oraz na stanowiskach pracy – monitoringiem wykorzystujacym nowoczesne systemy informatyczne, metodami oczyszczania i dezynfekcji powietrza
 - biofilmami w systemach wody zimnej i ciepłej – monitoringiem, metodami dezynfekcji oraz skutecznymi strategiami antybiofilmowymi
 - adhezją mikroorganizmów oraz linii komórkowych do powierzchni abiotycznych i biotycznych
 - mechanizmami cyto- i genotoksyczności prób środowiskowych oraz poszukiwaniem naturalnych sposobów detoksykacji.
 - probiotykami, prebiotykami, synbiotykami, postbiotykami (aktywnością protekcyjną - antygenotoksyczną, antyoksydacyjną, proapoptotyczną i antyproliferacyjną wobec linii komórkowych).
 - odnawialnymi źródłami energii
 - wytwarzaniem biogazu, biometanu i biowodoru z odpadów i biomasy pochodzenia roślinnego, zwierzęcego i komunalnego
 - biogazowaniem rolniczym, komunalnym i przemysłowym
 - oczyszczaniem biogazu na drodze biokonwersji
 - obróbką wstępną materiałów lignocelulozowych pochodzących z przemysłu rolno-spożywczego i pokrewnych
 - biologicznymi i chemicznymi metodami oczyszczania ścieków z różnych gałęzi przemysłu.
 - tlenową i beztlenową stabilizacją komunalnych osadów ściekowych
 - wykorzystaniem biomasy mikroalg do oczyszczania ścieków i odcieków pofermentacyjnych
 - zagospodarowaniem odpadów i masy pofermentacyjnej
 - biologicznymi metodami dezodoryzacji pomieszczeń chowu i hodowli zwierząt